Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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SP6Q3SY56 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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SP6Q3SY56 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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SP6Q3SY56 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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SP6Q3SY56 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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SP6Q3SY56 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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