Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP27-1Q3LI81 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms