Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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