Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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