Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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