Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HIST3H3Q16695 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HIST3H3Q16695 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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