Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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