Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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