Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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NCOA1Q15788 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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NCOA1Q15788 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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