Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms