Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms