Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms