Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms