Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NR1D2Q14995 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NR1D2Q14995 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NR1D2Q14995 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NR1D2Q14995 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NR1D2Q14995 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NR1D2Q14995 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms