Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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