Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms