Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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