Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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