Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms