Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms