Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms