Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms