Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms