Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms