Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP1Q00587 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms