Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKOR1P84550 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms