Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMF1P82094 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMF1P82094 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms