Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms