Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP46P62068 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP46P62068 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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