Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms