Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OXCT1P55809 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OXCT1P55809 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms