Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF10P55107 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF10P55107 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF10P55107 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF10P55107 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms