Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHBP55084 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms