Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF135P52742 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms