Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTAP49354 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms