Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX1P48742 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX1P48742 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms