Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1DP48730 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1DP48730 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1DP48730 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1DP48730 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1DP48730 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1DP48730 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1DP48730 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1DP48730 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1DP48730 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms