Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ME1P48163 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ME1P48163 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms