Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTRNP46939 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTRNP46939 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTRNP46939 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms