Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP5P45974 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP5P45974 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP5P45974 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms