Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC1A2P43004 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms