Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A4P31645 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms