Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCAP28676 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCAP28676 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GCAP28676 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCAP28676 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCAP28676 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCAP28676 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GCAP28676 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCAP28676 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCAP28676 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms