Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms