Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LMO1P25800 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LMO1P25800 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LMO1P25800 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LMO1P25800 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LMO1P25800 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LMO1P25800 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LMO1P25800 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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