Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHP20396 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHP20396 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHP20396 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRHP20396 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRHP20396 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRHP20396 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms