Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TNNI3P19429 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TNNI3P19429 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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