Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms