Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL162253.1-201ENST00000443792 758 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms