Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms